发酵翻堆机的主要原理是通过微生物的作用，将猪粪便中的有机物质转化为肥料。在发酵过程中，微生物将猪粪便中的有机物质分解为简单的化合物，如二氧化碳和水。同时，微生物的代谢产物和未消化的残留物形成肥料。通过翻堆机的搅拌和通风，可以有效地控制发酵过程中产生的热量和湿度，促进微生物的生长和繁殖，加速有机物的分解和肥料的形成。